きまぐれ研究室

座右の名は、"let it be"ですかね

Rでマルチプルアライメントを可視化しよう

マルチプルアライメントを可視化するRパッケージに、ggmsaを見つけた。 yulab-smu.top 可視化するために、気に入った見た目にできるツールがあまりなかったので良かった。 (雑な)使い方:とりあえず使ってみる DNAの時 library(ggmsa) library(ggplot2) msa_f…

シロイヌナズナでedgeRの結果に、TAIR10のfunctional descriptionを加えるには?

注意 一応うまく行っているか確認しながらやってください。 やりたいこと edgeRで出力した発現変動遺伝子の結果に、TAIR10からダウンロードした"functional description"を加えて一つの表にする。 手順 1. edgeRで発現変動遺伝子を取り出す。 サンプルコード…

このブログについて

よくブログを読んで、貴重な情報源になっていることが多いので書いてみることにしました。 たまーに書くだけですが、役に立ったら嬉しいです。 備忘録も兼ねています。